生物安全柜必須以良好的習慣使用，以為工人提供保護。建議采取以下保護措施：
　　1、如果安全柜已關閉，則鼓風機應運行至少四分鐘，然后才能開始工作以使生物安全柜“吹掃”。吹掃將清除安全柜中的所有懸浮顆粒。
　　2、應使用70％的乙醇，1：100的家用漂稀釋劑或其他適當的消毒劑擦拭工作表面，內壁，窗戶的內表面以及放在安全柜中的材料。使用漂白劑時，有必要再次用無菌水擦拭以除去殘留的氯，氯可能腐蝕不銹鋼表面。
　　3、開始工作之前，請先將材料放入BSC中。這樣可以更大程度地減少對氣簾的損壞。
　　4、BSC只能放置立即工作所需的材料和設備。
　　5、將工作流程安排為“干凈到臟”。
　　6、開始工作之前，請確保窗扇返回其原始位置。
　　7、緩慢地移入和移出手臂，以免打斷氣幕并危及安全殼。
　　8、將手/手臂放入內部后，應將物料搬運延遲約一分鐘。

9、所有操作均應在距前格柵至少四英寸的工作面上進行。
　　10、將移液器收集在安全柜中，以避免頻繁的向內/向外移動。在清除安全柜中所有可能被污染的材料之前，請對其進行消毒。
　　11、限制房間內的其他活動（在安全柜附近移動，行人通行，打開/關閉房間的門），因為這也可能損壞安全柜的空氣屏障。
　　不要怪我過分強調！生物安全柜養成良好的使用習慣很重要！必須由經過培訓的人員按照嚴格的協議對BSC進行例行檢查和測試，以驗證BSC是否正常運行。每年進行一次認證，每次移動安全柜時都要進行認證。